荆州公交下辖四个营运分公司（一公司、二公司、三公司、四公司）、一个汽车大修厂（修理公司）以及兴成驾校、楚天公交国际旅行社、公交出租车公司、荆州公交广告公司、充电公司、校车公司、物资经销公司12个二级经营单位。
总公司下设12个科室（综合办公室、工会、劳资科、技术科、营调科、安保服务稽察科、监察审计科、财务科、企管办、电子信息部、票务科、行政科），9个党支部（一公司党支部、二公司党支部、三公司党支部、四公司党支部、修理公司党支部、出租车公司党支部、科室党支部、综合党支部、兴成驾校党支部）。
